Organizace Česku vyčítá i nerovný přístup romských dětí ke vzdělání v České republice, dlouhý proces v kauze romského památníku v Letech a také vývoz zbraní do zemí, ve kterých mohou být české zbraně použity při činech porušujících lidská práva.
Amnesty International nadále připomíná prosincovou žalobu Evropské komise na Česko, Polsko a Maďarsko. Všechny tyto státy odmítají program přerozdělování žadatelů o azyl podle kvót. Organizace uvádí, že Česká republika přijala pouze 12 žadatelů, celkově byla ČR přidělena kvóta 2 691 lidí.
Organizace nadále kritizuje, že romské děti jsou stále diskriminovány v přístupu ke
vzdělání. Podle výroční zprávy rady české vlády pro lidská práva za rok 2016 se v českých vzdělávacích institucích i dnes objevuje diskriminace romských dětí, jež se často učí v oddělených romských třídách nebo školách.
Naposledy se organizace diví i tomu, že Česko nadále vyváží zbraně do zemí, kde můžou být využity k porušování lidských práv.