Jak je známo, město bylo založeno ve 20. letech 20. století na východním břehu slaného jezera Epecuén. V sedmdesátých letech Villa Epecuén zažíval rozvoj: byla vybudována železnice, vytvořena dobrá infrastruktura. Do města jezdilo hodně turistů.

V roce 1985 se kvůli prudkým dešťům zvedla úroveň vody a hráze, která byla na jezeru Epicuén postavena, nezvládla nápor vody a protrhla se. Celé město se ocitlo pod vodou. Jeho obyvatelé byli evakuováni. Podle Wikipedie se k roku 1993 opuštěné městečko naházelo v hloubce 10 metrů.

Po 25 letech se hladina vody začala pomalu snižovat, díky čemu bylo městečko znovu objeveno. Skoro nic z něho nezbylo, na místě jsou rozvaliny a pár celých¬, ale poškozených budov. V roce 2009 se sem vrátil jediný obyvatel, který žil v tomto městě do děsivé povodně. Jmenuje se Pablo Novak, o kterém byl později natočen film Pablo's Villa představený na festivalu v Sydney.

V současnosti je Villa Epecuén turistickou atrakcí. Návštěvníci sem přijíždějí, aby získali nové, unikátní a nezapomenutelné zážitky.