Novináři britského deníku The Guardian a francouzského listu Le Monde informovali, že český předseda vlády má možnost řídit a ovlivňovat rozhodovací procesy spojené s využíváním fondů přicházejících z evropského rozpočtu. Na svém portálu to uvádí Lidové noviny. Zpráva organizace Transparency International tvrdí, že by český premiér mohl být konečným uživatelem výhod svěřeneckých fondů, do nichž převedl akcie Agrofertu.

Podle znění 61. článku nařízení o pravidlech pro unijní rozpočet ke střetu zájmu dochází tehdy, kdy je ohrožen nestranný a objektivní výkon funkcí, a to kvůli rodinným důvodům, citovým vazbám, politické nebo národní sblíženosti. V souvislosti s uvedenou definicí právníci tvrdí, že v případě premiéra Andreje Babiše by se mohlo jednat o konflikt zájmů z rodinných důvodů. Myslí si to především proto, že je Babišova manželka Monika zapojena do činnosti skupiny Agrofert.

Právníci ale při vyšetřování střetu zájmů konstatovali, že bude potřeba podrobit tzv. finanční korekci Evropské fondy, ze kterých byly vyplaceny peníze za porušení pravidel. České republice tak hrozí, že bude muset vrátit alespoň část z dotací v hodnotě 82 milionů eur (2,1 miliardy korun), které v tomto roce z rozpočtu EU získala.

Právníci Evropské komise ve své zprávě také zmínili předsednictví Andreje Babiše v Radě pro Evropské strukturální a investiční fondy. A jak uvádí portál lidovky.cz, jde o hlavní orgán koordinující podporu ze všech strukturálních a investičních fondů ve stávajícím finančním rámci do roku 2020.

„Je v první řadě na českých úřadech, aby přijaly odpovídající opatření. Komise by ze své strany měla přemýšlet o způsobech, jak by mohla na takový konflikt zájmů reagovat, pokud dotčená osoba zůstává v postavení, kterým porušuje pravidla článku 61," vyjádřila se k situaci právní služba.